Молекулярная селекция клубники значительно сокращает время создания новых сортов, что позволяет быстрее получать ягоды с улучшенными характеристиками. Вместо ожидания плодоношения несколько лет, селекционеры могут сразу оценивать генетический потенциал растений через ДНК-маркеры, уменьшая цикл разработки с 10–15 лет до 5–7.
Эта технология позволяет одновременно встраивать в один сорт гены устойчивости к нескольким патогенам (пирамидирование генов). Основные цели включают антракноз (ген Rca2), фитофтороз и гнили корней, мучнистую росу (локус Oat-f), а также сложную для генетиков серую гниль ботритис.
Молекулярные методы также дают возможность работать с признаками, которые трудно оценить визуально. Это касается вкуса и аромата, где ищут гены синтеза сахаров и ароматических соединений, часто утрачиваемых при классической селекции 'на размер'. Кроме того, выявляются маркеры для плотности и лежкости, важные для транспортировки, и генетический контроль внешнего вида ягоды — блеска, формы и равномерности окраски.
Исследователи дополнительно работают над архитектурой куста и повышением стрессоустойчивости.
Тим Коореваар из Вагенингенского университета отмечает, что молекулярная селекция алло-октоплоидной земляники (Fragaria × ananassa) затруднена высоким сходством субгеномов, что осложняет выявление вариантов при полногеномном секвенировании (WGS). Он разработал надежный алгоритм для внедрения генотипирования на основе WGS в практическую селекцию.
Коореваар объясняет, что сначала была отобрана репрезентативная основная коллекция для отражения генетического разнообразия. Затем метод фильтрации, основанный на неравновесии сцепления и балансе аллелей, удалил ошибочные SNP из-за сходства субгеномов. Используя надежные SNP, создали референсные панели гаплотипов для точного восполнения недостающих данных секвенирования. Эти гаплотипы затем применялись для картирования генетического разнообразия и регионов, отобранных в селекционных популяциях и с течением времени.
Эта работа превращает полногеномное секвенирование в гибкий инструмент генотипирования, поддерживающий ежедневные селекционные решения и долгосрочное управление генетическим разнообразием клубники. Она также предоставляет план, который может быть адаптирован для других культур с незначительными корректировками.
